JuseKit

JUst a SEquence toolKIt for Transcriptomics

基于 Python v3.10 和 PyQt5 开发，软件打包使用 pyinstaller 进行，请在右侧 Release 下载。

JuseKit.zip 解压后使用文件夹中的 Jusekit.exe 打开。

古早版本可以直接下载 JuseKit.exe 打开，但运行速度和性能等可能有所下降。

在该 repository 的 examples 文件夹下储存着用于运行 JuseKit 的示例数据。

另外的运行方式

该软件也可直接使用源码运行，不过需要安装好已使用的包：

git clone https://github.com/JuseTiZ/JuseKit.git
cd JuseKit
python JuseKit_window.py

如果你想自行编译成 exe 文件，可以通过 pyinstaller 进行：

git clone https://github.com/JuseTiZ/JuseKit.git
cd JuseKit
pyinstaller --noconsole --name=JuseKit --icon=jusekit.ico JuseKit_window.py --hidden-import=matplotlib.backends.backend_pdf

教程可见：Juse's blog

若存在报错 Bug 可以联系 Juse 修复。

目前已经实现的功能

• 提取最长转录本。
• 根据 id 提取序列。
• 对序列的 id 进行各种处理。
• 串联序列并得到分区信息。
• 批量进行序列格式转换。
• 批量提取 Orthofinder 的 orthogroup 对应的 CDS 序列。
• 批量进行序列的物种数和长度过滤。
• 火山图绘制。
• 气泡图绘制。
• 组装指标计算。

目前已有的小功能：

• 学习计时器。
• 批量改后缀。